故事的主人公是喜欢魔法的高中生黒羽快斗，他的父亲是在8年前因事故而死亡的大魔法师·黒羽盗一。某日，他在房间一栋隐秘门中发现传说中的怪盗基德的衣服，于是他打算会见基德。在那里，他遇到了父亲过去的同伴·寺井，并得知父亲就是怪盗基德，而且死因不是事故死而是他杀。于是，快斗为查出杀害父亲的犯人，而自己成为了基德。本作和《名侦探柯南》有不少共通点。例如怪盗基德在两作中均有出现、迷之组织的登场、主人公真正身份不被世人所知，等等，感觉就像是融合了魔法元素的柯南。

一次手术中，年幼的病人身上发生了可怕的麻醉觉醒事故。这恐怖的经历和巨大的疼痛让病人的性格发生了一百八十度的转变，甚至在出院后犯下了连杀数人的不可饶恕的罪过而被关入了精神病院。当然，这场事故的责任，被归于主刀医生，即柳在宇（金敏明 饰）的父亲的身上。继病人在精神病院神秘失踪后，柳在宇的父亲也一蹶不振。一转眼，25年过去了。就当众人以为事故带来的伤痛早已平息的时候，已经成年的病人再度现身了，围绕着他发生的，是又一连串的非法神秘事件。为了查明真相，柳在宇联合同事张植浩（郑有锡 饰）和江旭焕（刘俊相 饰）等人，对

喜欢魔术的高中生黑羽快斗。父亲是天才魔术师，但也有世界大盗怪盗基德这一不为人知的一面。然而，他的父亲因魔术中的意外事故而去世了。自那8年后，快斗意外得知了父亲背后的一面，怀疑他非因事故而死，而是被什么人所杀害的。为了解除这个疑惑，快斗身着礼帽和白色斗篷，继承了父亲的轨迹，成为了怪盗基德。

西河市莲花沟金矿发生矿难，金矿矿主、鑫月国际俱乐部总经理冷小月正要赶赴现场，突然接到由虹影艺廊女老板柳风影转达的一个幕后人物的指令。之后冷将此令转达给黄金公司经理金玉良，金又转达给金把头崔天宝。于是一场特大矿难变成了一个只伤无亡的一般事故。

现代少年莫梵，在一次偶然事故后，变成天赋灵纹被夺的莫家嫡系少爷莫梵。在“金手指消息早知道”（早大人）的帮助下，莫梵恢复了天赋，并从早大人提供的信息中，得知青玄王宝藏的消息，同时也提前预知了爷爷数日后就会走火入魔的消息。为得到青玄王留下的传承来救爷爷，莫凡向青玄王的残魂立下心魔大誓……