1933年法国，亨利（查理·汉纳姆 饰）被误判谋杀罪，收押于法属圭亚那的一处流放地服刑。因为胸前有一处蝴蝶纹身，所以在那里别人都叫他“巴比龙”。在此过程中，他结识了因伪造文件和盗用公款被捕的路易斯（拉米·马雷克 饰）。路易斯确信自己的妻子会用他们的财产来保释他，与此同时，路易斯需要巴比龙的帮助来保护他不受其他想偷他钱的罪犯的侵犯。巴比龙同意了他的要求，作为交换，路易斯要资助他逃离这个岛。

变种人族群遭到了前所未有的毁灭性打击，而这一切的根源是“魔形女”瑞文在1973年刺杀了玻利瓦尔·特拉斯克。X教授和万磁王决定让金刚狼穿越回1973年，说服他们一起阻止魔形女的行动。

东博士发展称为仿生人的机器人，它不像真人害怕污染物且具有近似真人的智慧，目的是用来解决环境污染和生态保育问题，但意外机器人BK-1被电死后突然反叛人类，杀害了博士和多名科学家，并控制了其他机器人。因为是出于内部的暴乱，而且人类的军警也无法应对有人工智能的机器，导致机器人军团迅速征服了日本。在其开始征服世界前，东博士的儿子东铁也把自己改造成机械化人卡辛对抗机器人军团......